مقدمه
توانایی دقت تشخیص بین نژادهای پاتوژنهای عفونی برای نظارت اپیدمیولوژیکی کارآمد و تجزیه و تحلیل پایشی، مطالعه ساختار میکروبی جمعیت و پویایی و در نهایت، بهبود استراتژیهای کنترل بهداشت عمومی در حال توسعه، بسیار مهم است (2004). برای پیشبرد چنین اهداف کلی، روشهای مختلف تایپینگ مولکولی پیشنهاد شده که در بخشهای مختلف جهان، ایزوله ها (اپیدمیولوژی همه منظوره) و یا شیوع بیماری موضعی (اپیدمیولوژی محلی) مشخص می شود(به کار فولی و همکاران، 2009 برای بررسی نگاه کنید). با این حال، از سال 1998، "استاندارد طلایی" برای تایپینگ مولکولی پیشنهاد شده که تایپینگ توالی چندمکانی (MLST) نام دارد (مایدن و همکاران، 1998). MLST بر مبنای مفاهیم ژنتیکی خوب استقرار یافته جمعیتی و روشهای الکتروفورز چندمکانی آنزیم (MLEE) ساخته شده، اما مزایای قابل توجهی نسبت به دیگر روشهای تایپینگ دارد (به بخش 17.4، برای مزایا و هشدارها مراجعه کنید).MLST، تنوع نوکلئوتید در توالی قطعات داخلی را بررسی می کند که اغلب هفت ژن اداره کننده (هاوس کیپینگ) را در بر میگیرد.
تایپینگ توالی چندمکانی پاتوژن