کوشا فایل
کوشا فایل بانک فایل ایران ، دانلود فایل و پروژهکوشا فایل
کوشا فایل بانک فایل ایران ، دانلود فایل و پروژهپایان نامه بررسی رابطه ی پلی مورفیسم ژن رسپتور اکسی توسین در دو جایگاه rs2254298 و rs53576 در بیماران مبتلا به اسکیزوفرنی
اختصاصی از کوشا فایل پایان نامه بررسی رابطه ی پلی مورفیسم ژن رسپتور اکسی توسین در دو جایگاه rs2254298 و rs53576 در بیماران مبتلا به اسکیزوفرنی دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .
فرمت فایل : WORD (قابل ویرایش)
تعداد صفحات:54
پایان نامه کارشناسی ارشد در رشته¬ی زیست شناسی- ژنتیک
فهرست مطالب:
عنوان صفحه
فصل اول: مقدمه............................................................................................................ 1
1ـ1ـ مقدمه.............................................................................................................................................. 2
فصل دوم: مروری بر منابع.............................................................................................. 4
2ـ1ـ تعریف اسکیزوفرنی....................................................................................................................... 5
2ـ2ـ تاریخچه........................................................................................................................................... 5
2ـ3ـ اپیدمیولوژی................................................................................................................................... 5
2ـ4ـ علائم................................................................................................................................................ 5
2ـ4ـ1ـ علائم مثبت................................................................................................................................ 6
2ـ4ـ2ـ علائم منفی................................................................................................................................. 6
2ـ4ـ3ـ نقائص شناختی.......................................................................................................................... 6
2ـ5ـ انواع اسکیزوفرنی............................................................................................................................. 6
2ـ6ـ اتیولوژی............................................................................................................................................. 7
2ـ7ـ وراثت پذیری و اثرات محیطی...................................................................................................... 7
2ـ8ـ هیپوکامپ در اسکیزوفرنی............................................................................................................. 7
2ـ9ـ اکسی توسین و گابا در اختلال اسکیزوفرنی.............................................................................. 7
2ـ10ـ اکسی توسین و متابولیک ایمنی اسکیزوفرنی......................................................................... 8
2ـ11ـ هورمون.......................................................................................................................................... 9
2ـ11ـ1ـ انواع هورمون............................................................................................................................ 9
2ـ11ـ2ـ نحوه انتقال هورمون در خون............................................................................................... 9
2ـ11ـ3ـ نحوه تاثیر هورمون ها............................................................................................................ 9
2ـ11ـ4ـ غده هیپوفیز............................................................................................................................. 10
2ـ12ـ ویژگی های عمومی اکسی توسین........................................................................................... 10
2ـ13ـ نقش اکسی توسین...................................................................................................................... 11
2ـ14ـ کنترل ترشح اکسی توسین....................................................................................................... 11
2ـ15ـ توزیع و نقش گیرنده های اکسی توسین................................................................................ 12
2ـ16ـ فعال سازی سیگنالینگ PKC از طریق Gـ پروتئین............................................................ 13
فصل سوم: مواد و روش ها............................................................................................... 15
3ـ1ـ جمع آوری نمونه............................................................................................................................. 16
3ـ2ـ نمونه گیری....................................................................................................................................... 16
3ـ3ـ مواد و محلول های مورد نیاز برای انجام استخراج................................................................... 16
3ـ4ـ مراحل استخراج............................................................................................................................... 17
3ـ5ـ واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR)............................................................................................ 18
3ـ6ـ بررسی پلی مورفیسم rs2254298 ژن OXTR..................................................................... 19
3ـ7ـ فرایند انجام واکنش PCR............................................................................................................. 19
3ـ7ـ1ـ مواد و وسایل مورد نیاز برای انجام PCR............................................................................... 19
3ـ7ـ2ـ محلول های مورد نیاز برای واکنش PCR.............................................................................. 20
3ـ7ـ3ـ روش کار........................................................................................................................................ 20
3ـ7ـ4ـ مراحل انجام PCR...................................................................................................................... 21
3ـ8ـ RFLPـPCR..................................................................................................................................... 22
3ـ8ـ1ـ مراحل و مواد مورد نیاز برای انجام RFLP............................................................................ 23
3ـ8ـ2ـ آنزیم BsrӀ.................................................................................................................................... 23
3ـ8ـ3ـ روش کار........................................................................................................................................ 23
3ـ9ـ مراحل و مواد مورد نیاز برای انجام الکتروفورز........................................................................... 24
3ـ9ـ1ـ مواد مورد نیاز............................................................................................................................... 24
3ـ9ـ2ـ تهیه ژل آگارز 3 درصد............................................................................................................... 24
3ـ10ـ بررسی پلی مورفیسم rs53576............................................................................................... 25
3ـ10ـ1ـ آنزیم BamHӀ........................................................................................................................... 25
3ـ10ـ2ـ روش کار...................................................................................................................................... 26
3ـ11ـ آنالیز آماری...................................................................................................................................... 26
فصل چهارم: نتایج............................................................................................................. 27
4ـ1ـ اطلاعات بیماران و افراد سالم......................................................................................................... 28
4ـ2ـ بررسی پلی مورفیسم rs2254298 در ژن گیرنده اکسی توسین......................................... 29
آنالیز آماری................................................................................................................................................... 30
4ـ3ـ بررسی پلی مورفیسم برای (A/G) ژن OXTR........................................................................... 32
4ـ3ـ1ـ آنالیز آماری..................................................................................................................................... 33
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری و ارائه پیشنهادات.......................................................... 34
5ـ1ـ بحث........................................................................................................................................................ 35
5ـ2ـ پیشنهادات............................................................................................................................................. 37
مراجع................................................................................................................................... 38
فهرست جدول ها
عنوان جدول صفحه
جدول 3-1 مشخصات پرایمر برای جایگاه rs2254298 ................................................ 19
جدول 3-2 مقدار مواد مورد نیاز برای ساخت مخلوط PCR........................................... 20
جدول 3-3- شرایط دمایی مورد نیاز PCR و پرایمرها....................................................................... 22
جدول 3-4-اندازه باندهای ایجاد شده توسط BsrӀ در پلی مورفیسم rs2254298............... 23
جدول 3-5-مواد مورد نیاز برای برش مورد نظر در جایگاه rs2254298.......................... 23
جدول 3-6- مشخصات پرایمر برای جایگاه rs53576................................................... 25
جدول 3-7- اندازه باندهای ایجاد شده توسط BamH Ӏ در پلی مورفیسم rs53576............ 26
جدول 3-8- مواد مورد نیاز مختص rs53576............................................................. 26
جدول 4-1- مشخصات دموگرافیک گروه های بیمار و کنترل.......................................................... 28
جدول 4-2- بررسی P-value ویژگی های دموگرافیک در دو گروه بیمار و کنترل..................... 29
جدول 4-3-مقایسه فراوانی ژنوتیپی در پلی مورفیسم rs2254298.................................. 31
جدول 4-4-مقایسه فراوانی ژنی در پلی مورفیسم rs2254298....................................... 31
جدول 4-5- مقایسه فراوانی ژنوتیپی در پلی مورفیسم rs53576..................................... 33
جدول 4-6- مقایسه فراوانی ژنی در پلی مورفیسم rs53576........................................... 33
فهرست شکل ها
عنوان شکل صفحه
شکل 2ـ1ـ جایگاه ژنومی OXTR................................................................................... 11
شکل 2ـ2ـ مسیر سیگنالینگ PKC.............................................................................. 14
شکل 3ـ1ـ DNA استخراج شده از نمونه های خون بر روی ژل آگارز 1%........................... 18
شکل 4ـ1ـ تصویر ژل آگارز %3 برای پلی مورفیسم rs2254298............................. 30
شکل 4ـ2ـ تصویر ژل آگارز %3 برای پلی مورفیسم rs53576.............................................. 32
فهرست علائم
علامت نشانه
SZ اسکیزوفرنی
nm نانومتر
ml میکرولیتر
M مولار
g/ml میکرولیتر بر گرم
nM نانومولار
w/v حجمی ـ وزنی
v/ حجمی ـ حجمی
bp جفت باز
Min دقیقه
rpm دور در دقیقه
چکیده
پیش زمینه: با مطالعات بر روی دوقلوها می توان به نقش عوامل ژنتیکی در اسکیزوفرنی پی برد. اسکیزوفرنی را می توان یکی از مخرب ترین اختلالات روانی برشمرد. افراد مبتلا، رفتارهایی خشن بروز می دهند. اکسی توسین نقش بسزایی در بروز رفتارهای اجتماعی_احساسی دارد. در مطالعه حاضر، هدف ما یافتن رابطه ای بین پلی مورفیسم ژن گیرنده اکسی توسین و خطر ابتلا به اسکیزوفرنی بود.
روش ها: در این مطالعه، DNA از نمونه های خون 200 فرد بیمار و سالم جداسازی شده و دو پلی مورفیسم rs2254298 و rs53576 از ژن گیرنده اکسی توسین را با استفاده از تکنیک PCR-RFLP مورد بررسی قرار دادیم.
نتایج: در این پژوهش اختلاف معناداری بین دو جایگاه پلی مورفیسم ژن گیرنده اکسی توسین(OXTR) و خطر ابتلا به اسکیزوفرنی مشاهده نشد.
نتیجه گیری: در این پژوهش، نتایج ما نشان می دهد که رابطه ی معناداری بین این دو SNP و خطر ابتلا به اسکیزوفرنی وجود ندارد و بنابراین پیشنهاد می گردد که جایگاه های بیشتر این گیرنده مورد بررسی قرار گیرد.
کلمات کلیدی: اسکیزوفرنی، پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی(SNP)، ژن گیرنده اکسی توسین(OXTR).
پایان نامه بررسی ارتباط پلی مورفیسم های پروموتر ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان معده
اختصاصی از کوشا فایل پایان نامه بررسی ارتباط پلی مورفیسم های پروموتر ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان معده دانلود با لینک مستقیم و پرسرعت .
فرمت فایل : WORD (قابل ویرایش)
تعداد صفحات:90
پایان‌نامه برای دریافت درجه کارشناسی ارشد زیست شناسی
گرایش ژنتیک
فهرست مطالب:
چکیده .....................................................................................................................................................................................................1
فصل اول: کلیات تحقیق
1-1-.اپیدمیولوژی سرطان معده........................................................................................................................................................2
1-2- معده...............................................................................................................................................................................................3
1-2-1- کاردیا.....................................................................................................................................................................................4
1-2-2- طاق و تنه.............................................................................................................................................................................4
1-2-3- پیلور.......................................................................................................................................................................................5
1-3- سلول های موجود در غدد معده.............................................................................................................................................5
1-3-1- سلول های گردن مخاط....................................................................................................................................................5
1-3-2- سلول های تمایز نیافته.....................................................................................................................................................6
1-3-3- سلول های اصلی.................................................................................................................................................................6
1-3-4- سلول های کناری یا جداری ...........................................................................................................................................6
1-3-5- سلول های غدد درون ریز ................................................................................................................................................7
1-4- انواع سرطان معده.......................................................................................................................................................................7
1-4-1- آدنوکارسینوم نوع روده ای................................................................................................................................................7
1-4-2- آدنوکارسینوم نوع منتشر...................................................................................................................................................8
1-5- اتیولوژی سرطان معده................................................................................................................................................................9
1-5-1 هلیکوباکتر پیلوری.................................................................................................................................................................9
1 -5-2- رژیم غذایی........................................................................................................................................................................10
1 -5-3- سیگار.................................................................................................................................................................................10
1-5-4- فاکتورهای ژنتیکی............................................................................................................................................................11
1-6- مخاط معده..................................................................................................................................................................................12
1-7- موکوس معده..............................................................................................................................................................................12
1-8- پروتئین های گاستروکین .......................................................................................................................................................13
1-8-1- ژن GKN1 .........................................................................................................................................................................15
1-8-2-نقش GKN1 در معده و سرطان معده..........................................................................................................................16
1-9- ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های ژنتیکی با خطر ابتلا به سرطان...............................................................................................18
1-10- اهداف تحقیق.........................................................................................................................................................................20
فصل دوم:پیشینه تحقیق
فصل سوم:مواد و روش ها
3-1- وسایل و مواد مورد استفاده در این مطالعه..........................................................................................................................24
3-2- نوع مطالعه...................................................................................................................................................................................26
3-3- جامعه آماری و نمونه گیری................................................................................................................................. ..................26
3-4- رضایت نامه..................................................................................................................................................................................27
3-5- روش تهیه محلول‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مورد نیاز جهت انجام الکتروفورز..................................................................................................27
3-5-1-روش تهیه بافر الکتروفورز TBE در حجم 500 میلی لیتر.........................................................................................27
3-5-2- محلول رنگ آمیزی DNA Stain ..................................................................................................................................28
3-6- استخراج DNA از خون.............................................................................................................................................................28
3-7- تهیه ژل آگارز و الکتروفورز.......................................................................................................................................................29
3-8- طراحی پرایمر..............................................................................................................................................................................30
3-9- تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1....................................................................................................................................... 31
3-10- توالی یابی...................................................................................................................................................................................35
3-11- شناسایی SNPهای پروموتر ژن GKN1 ............................................................................................................................35
3-12- تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR................................................................................................................................35
3-13- تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه های rs4575760 و rs4072127 با روش Tetra- primer ARMS PCR............37
3-14- آنالیز آماری...............................................................................................................................................................................42
پرسشنامه.................................................................................................................................................................................................43
فصل چهارم-نتایج
4-1- مشخصات جمعیت مورد مطالعه..........................................................................................................................................44
4-2- بررسی ارتباط فاکتورهای خطر با سرطان معده................................................................................................................47
4-2-1- عفونت هلیکوباکتر پیلوری............................................................................................................................................47
4-2-2- مصرف الکل.......................................................................................................................................................................48
4-2-3- ازدواج فامیلی والدین......................................................................................................................................................49
4-2-4- سابقه سرطان در خانواذه...............................................................................................................................................51
4-3- بررسی کیفیت DNA استخراج شده...................................................................................................................................51
4-4- تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1......................................................................................................................................52
4-5- شناساییSNP های ناحیه پروموتری ژن GKN1............................................................................................................53
4-6- تعیین ژنوتیپ SNPبا شناسه‌های rs4575760 وrs4072127 با تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR.........55
4-7- بررسی ارتباط پلی مورفیسم rs 4575760 ژنGKN1 با خطر ابتلا به سرطان معده..............................................58
4-8- بررسی ارتباط پلی مورفیسم rs 4072127 ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان معده..............................................58
4-9- بررسی ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های ژنGKN1 با نوع تومور............................................................................................60
فصل پنجم-بحث و نتیجه گیری
5-1- عوامل موثر در ابتلا به سرطان معده.................................................................................................................................62
5-1-1- بررسی نتایج حاصل از اثر عفونت هلیکوباکتر پیلوری بر ابتلا به سرطان معده.................................................63
5-1-2- بررسی نتایج حاصل از تاثیر الکل با خطر ابتلا به سرطان معده...........................................................................63
5-1-3- سابقه سرطان در خانواده (اقوام درجه یک).............................................................................................................64
5-1-4- نتایج حاصل از بررسی ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های تک نوکلئوتیدی پروموتر ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان
معده......................................................................................................................................................................................................65
پیشنهادات.............................................................................................................................................................................................67
رفرنس....................................................................................................................................................................................................68
چکیده خارجی.....................................................................................................................................................................................78
فهرست شکل ها
شکل 1-1-قسمت‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مختلف معده...............................................................................................................................................4
شکل 1- 2- ترکیبات تشکیل دهنده موکوس.............................................................................................................................12
شکل1 - 3- ساختار فضایی پروتئین های گاستروکین.............................................................................................................14
شکل 1-4- بیان GKNS، TFFS و موسین‌ها در اپیتلیوم معده موش.....................................................................................14
شکل 1-5- جایگاه ژنهای GKN1، GKN2 و GKN3 بر روی کروموزوم 2 انسان...........................................................15
شکل 1-6- موقعیت 38CYS در 3 ژنGKN1، GKN2 و GKN3.......................................................................................16
شکل 3-1: نمایی از تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR....................................................................................................36
شکل 4-1: الکتروفورز DNA استخراج شده بر روی ژل آگارز 1 درصد. .............................................................................51
شکل 4-2: تکثیر بخشی از ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1A)................................................................................52
شکل 4-3: تکثیر بخشی از ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1B)...................................................................................53
شکل 4-4 : مقایسه توالی ناحیه پروموتر ژن GKN1 با نرم افزار SeqMan ........................................................................54
شکل 4-5: ژنوتیپ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مختلف در SNP rs 4557760 در پروموتر ژن GKN1.................................................................54
شکل4-6 :ژنوتیپ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های مختلف در SNP 72127 rs 40 در پروموتر ژن GKN1 ................................................................55
شکل4-7: تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه 4557760 rs ژن GKN1 با تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR...........56
شکل4- 8: تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه 4072127 rsژن GKN1 با تکنیک .Tetra Primer ARMS- PCR.........57
شکل 5-1: نواحی پروموتری ژنهای GKN2، TFF1، TFF2 و TFF3 و فاکتورهای رونویسی مربوط به این ژن‌ها....67
فهرست جداول
جدول 1-1- خلاصه ای از پلی مورفیسم‌ها‌یی که با انواع منتشر و روده ای سرطان معده در ارتباط هستند...............19
جدول 3-1- توالی پرایمرهای GKN1A و GKN1B...................................................................................................................32
جدول 3-2- شرایط PCR جهت تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1A و GKN1B ).........................................33
جدول 3-3- میزان مواد مورد نیاز PCR جهت تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1.............................................................34
جدول 3-5- توالی پرایمرهای مورد استفاده در Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4575760........37
جدول 3-6- توالی پرایمرهای مورد استفاده در Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4072127........38
جدول 3-7- مواد و حجم مورد نیاز برای انجام Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپrs 4575760 ......39 جدول 3-8- مواد و حجم مورد نیاز برای انجام Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs 4072127 ....40 جدول3-9- شرایط PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4575760................................... ................................41 جدول3-10- شرایط PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4072127...................................................................................................41 جدول4-1: مشخصات نمونههای جمعیت A...............................................................................................................................45
جدول4-2: مشخصات نمونههای جمعیت B...............................................................................................................................46
جدول 4-3: ژنوتیپ نمونههای بیمار و شاهد پلیمورفیسم rs 4557760 ............................................................................59
جدول 4-4: ژنوتیپ نمونههای بیمار و شاهد پلی مورفیسم rs 4072127 ..........................................................................59
فهرست نمودارها
نمودار4-1- فراوانی سرطان های Intestinal (19 نفر)و diffuse (12 نفر) در بیماران آلوده به هلیکوباکتر پیلوری در
جمعیت A............................................................................................................................................................................................47
نمودار 4-2- فراوانی سرطان های Intestinal (17 نفر) و diffuse (11 نفر) در مبتلایان به هلیکوباکتر پیلوریدر
جمعیت B...........................................................................................................................................................................................48
نمودار4-3: فراوانی افراد الکلی و غیر الکلی در گروه بیمار و شاهد در جمعیت A............................................................49
نمودار 4-4: فراوانی افراد الکلی و غیر الکلی در گروه بیمار و شاهد در جمعیتB ..........................................................49
نمودار 4-5: فراوانی ازدواج فامیلی و غیر فامیلی والدین در گروه بیمار و شاهد جمعیت A..........................................50
نمودار 4-6: فراوانی ازدواج فامیلی و غیر فامیلی والدین در گروه بیمار و شاهد جمعیت B.........................................50
چکیده
مقدمه: سرطان معده شایع ترین سرطان در کشورهای آسیایی محسوب می‌‌‌‌‌‌‌‌شود و در ایران نیز به عنوان شایع ترین و اولین علت مرگ و میر به دلیل سرطان در میان مردان و دومین علت مرگ و میر در میان زنان است. یکی از عواملی که با سرطان معده ارتباط دارد، تغییر در ترکیب موکوس معده است که سطح اپیتلیال معده را پوشانده است. هدف: یکی از فراوان ترین پروتئین‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های موجود در موکوس معده گاستروکین 1 است که توسط ژن GKN1 در انسان کد می‌‌‌‌‌‌‌‌شود. این پروتئین در عملکرد طبیعی معده مثل تمایز طبیعی سلول‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های اپیتلیال معده، یکپارچگی مخاط و ترمیم سلول‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های اپیتلیال معده پس از آسیب نقش مهمی ایفا می کند. بیان ژن GKN1 در سرطان معده کاهش می یابد و از این ژن به عنوان ژن سرکوب کننده تومور در معده نام برده می شود.
مواد و روش ها: با توجه به نقش مهم گاستروکین 1 در اپیتلیوم معده و کاهش بیان ژن GKN1 در سرطان معده و نقش تنظیمی پروموتر در بیان ژن ها، در این مطالعه 52 بیمار مبتلا به سرطان معده و 52 فرد سالم انتخاب شده و پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های تک نوکلئوتیدی قرار گرفته در ناحیه پروموتری ژن GKN1 با استفاده از توالی یابی و تکنیک Tetra-primer ARMS PCR بررسی گردید.
نتیجه گیری: نتایج نشان داد که پلیمورفیسم تک نوکلئوتیدی rs 4575760 با خطر ابتلا به سرطان معده ارتباط دارد (032/0=P , 1=df ,9/0-1/0 =%95CI ,42/0=OR). اما پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs 4072127 با خطر ابتلا به سرطان معده ارتباط ندارد ( 13/0 =P , 1 =df , 52/4 - 8/0=%95CI , 919/1 =OR).
کلمات کلیدی: سرطان معده، ژن GKN1، پروموتر، پلیمورفیسم تک نوکلئوتیدی، Tetra-primer ARMS- PCR.